Este trabajo presenta a la racionalidad política de la pena moderna como un sistema que, en su vigencia actual, no resulta plenamente compatible con el marco constitucional del saber penal que debe abordar el derecho de ejecución penal. Persiste una antinomia entre la regulación constitucional de penas prohibidas, cuya principal característica es el trato punitivo que se aplica durante la condena, y aquello que representa a la medida de castigo como inmutable en un solo acto que es la sentencia. A partir de aquí el objetivo de este trabajo es definir algunos lineamientos en la pretensión de procurar una reconstrucción conceptual y sistemática de la ejecución de la pena cuya principal proyección se define en las mutaciones que la medida de castigo fijada en la sentencia tiene ante tratos punitivos arbitrarios que la distorsionan durante su ejecución.