En general, se ha abordado el Programa de Incentivos a Docentes-Investigadores de Universidades Nacionales -diseñado e implementado en la Argentina a partir de 1994- como parte de la política pública de educación superior. Dicha política ha sido enmarcada durante los años noventa en una nueva relación entre el Estado y las instituciones del sector que presentó como rasgo sobresaliente una injerencia mayor del mismo en el ámbito universitario, injerencia entendida como pérdida de autonomía mediante la acción de un “Estado evaluador”. En este trabajo buscamos presentar al mencionado Programa como parte de la política científico-tecnológica argentina y desde allí entender la acción del Estado en el marco de un nuevo relacionamiento entre la comunidad científica y el gobierno, entre la universidad y la sociedad. En primer lugar, se presentan las herramientas analíticas empleadas en el trabajo, combinación de los estudios de Sociología Política de la Ciencia y del Análisis de Políticas Públicas. En segundo lugar, se realiza una descripción y caracterización de la política científico-tecnológica implementada durante los años noventa, para luego explorar el Programa de Incentivos como instrumento de dicha política. Finalmente, se exponen las nuevas interpretaciones surgidas a partir de la propuesta de análisis presentada.